Gyomaendrőd Város Önkormányzata Képviselő-testületének és szerveinek szervezeti felépítését és szervezeti kapcsolatát a Magyarország helyi önkormányzatairól szóló 2011. évi CLXXXIX. törvény, valamint Gyomaendrőd Város Önkormányzata Képviselő-testületének a Képviselő-testület és Szervei Szervezeti és Működési Szabályzatáról szóló 12/2013. (V. 10.) önkormányzati rendelete, a végrehajtására kiadott Gyomaendrődi Közös Önkormányzati Hivatal Szervezeti és Működési Szabályzata továbbá a hivatal, mint költségvetési szerv ügyrendje rendezi.
A következő szervezeti diagram áttekintést ad a szervezeti kapcsolatokról.
(A Gyomaendrődi Közös Önkormányzati Hivatalt Gyomaendrőd Város Önkormányzata, Csárdaszállás Községi Önkormányzat és Hunya Község Önkormányzata alapította és tartja fenn.)